小三阳的患者是否能够根治，取决于患者感染过程当中是急性的还是慢性的。
如果是急性的乙肝，在感染的早期，部分患者的E抗原可能已经转阴，变成了小三阳，也有部分患者DNA很早就已经阴转，所以如果小三阳是急性感染，百分之九十五的成年人感染是可以彻底治愈的，如果是儿童时期感染的急性乙肝，多数会转为慢性。
对于慢性乙肝来说，如果是小三阳，如果DNA是阳性，或者是DNA是阴性的表面抗原阴转的，达到临床治愈的几率相对来说不是很高，但也不是没有可能。因为现在采取了干扰素治疗，或者是干扰素联合核苷类似物治疗。治疗后有一少部分患者可以实现表面抗原的阴转，表面抗原阴转之后，称为临床治愈，并不是乙肝病毒从体内彻底清除了，即使表面抗原阴转了，也有可能肝细胞内还存在一定量的病毒，所以将来免疫功能低下的时候，也有可能有些人还会再次复发。所以现在目前慢乙肝，无论是大三阳还是小三阳，现在都不能彻底根治，而是达到了临床治愈，但实现临床治愈的患者其实也并不是很多，绝大多数患者目前还要需要维持的治疗。
