关于合作医疗住院报销比例，具体标准因地区政策、医院等级及费用类型而异，以下为综合整理：

一、报销比例分医院等级

1. 村级/乡镇卫生院

   • 门诊：60%

   • 住院：60%（无起付线）

   • 特殊疾病（如儿童先心病、肺癌）：最高70%

2. 县级/二级医院

   • 门诊：40%

   • 住院：70%（起付线500元）

   • 大病治疗：75%-85%

3. 三级医院

   • 门诊：20%

   • 住院：55%-60%（起付线700元）

   • 特定疾病：最高70%

二、起付线标准

• 一般地区 ：400元以下无起付线，超过部分按比例报销

• 部分地区 ：如三级医院起付线700元、1000元等

• 新农合 ：三级医院起付线1000元，且设有5000元分段补偿机制

三、其他注意事项

1. 报销范围 ：仅限基本医疗保险药品目录、诊疗项目及急诊费用

2. 自费部分 ：包括起付线、超过报销比例的费用及药品/诊疗项目限额（如三级医院处方药200元/次）

3. 异地就医 ：需办理异地就医备案，报销比例可能降低5个百分点

四、示例计算（三级医院）

若某患者在三级医院住院花费2万元，报销情况如下：

• 起付线1000元，可报销1.9万元（按60%比例）

• 超出部分中，5000-10000元按55%报销，10000元以上按60%报销

• 总计报销约1.77万元，自付约2.23万元

建议参保人员就医前咨询当地医保部门，确认具体报销细则，尤其是新农合的特殊规定。