河源市治疗真菌性巩膜炎的医院推荐如下：
河源市人民医院
三级综合医院，风湿免疫科可提供相关诊疗服务，综合评分60分，地址位于源城区文祥路733号。
广东省人民医院河源医院
2021年由省人民医院对口帮扶的二级综合医院，学科发展依托省人民医院资源，适合复杂病例的专科治疗。
源城区人民医院
二级综合医院，设有风湿免疫科（含4位医生），地址在河源大道南136号，可初步筛查或转诊。
建议 ：真菌性巩膜炎属于眼科或风湿免疫科范畴，建议优先选择眼科或风湿免疫科较专业的医院（如河源市人民医院或广东省人民医院河源医院）。若当地医院专科资源有限，可考虑转诊至上级医院治疗。