单位交的医疗保险（职工医保）与新农合（城乡居民医保）的主要区别如下：
一、参保对象
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职工医保 ：覆盖城镇在岗职工、灵活就业人员等，需通过单位或个人缴费。
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新农合 ：主要覆盖农村居民，近年已与城镇居民医保合并为城乡居民医保，覆盖未参加职工医保的城镇非从业居民。
二、缴费主体与方式
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职工医保 ：由用人单位和个人共同缴纳，单位缴费比例约8%，个人缴费比例约2%，按月从工资中扣缴。
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新农合 ：过去由政府组织、农民自愿参加，现与城镇居民医保合并后，个人缴费约350元/年，政府补贴比例较高。
三、缴费金额与待遇
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缴费金额 ：职工医保按社平工资基数缴费，年缴金额较高；新农合按居民收入确定缴费基数，年缴金额较低（约300-400元）。
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报销比例与待遇 ：
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职工医保：门诊、住院报销比例较高（部分地区可达90%以上），设有年度报销上限（如30万）。
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新农合：住院报销比例约75%，门诊报销较少，且无年度上限。
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四、保障期限与终身性
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职工医保 ：男性缴满25年/女性20年后退休，终身享受待遇，个人账户可累计储存。
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新农合 ：需终身缴费，断缴则失去保障。
五、其他差异
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门诊报销 ：职工医保门诊可报销，新农合大部分地区仅限住院报销。
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生育津贴 ：职工医保可领取生育津贴（约1万），需缴费满1年；新农合无此待遇。
总结建议
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职工医保 适合有稳定工作、长期缴费的群体，保障全面且待遇优厚。
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新农合 适合农村居民或未参加职工医保的城镇非从业者，费用低但保障有限。
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若已参加职工医保，无需再单独缴纳新农合，两者不可同时享受。
