关于学生欠学费学校能否扣发毕业证的问题，根据中国的相关法律法规和教育部的指导意见，可以明确的是，学校不得以学生未缴纳学费为由拒绝发放毕业证书。这种做法被视为不合法，并且违反了《中华人民共和国教育法》以及《普通高等学校学生管理规定》中的相关规定。
《中华人民共和国教育法》保障了学生在完成规定的学业后获得相应学业证书的权利。这意味着只要学生达到了学校的学术要求并且完成了必要的学业，无论其是否拖欠学费，都有权获得毕业证书。《普通高等学校学生管理规定》也明确规定，学生在学校规定年限内修完教育教学计划规定内容，成绩合格达到学校毕业要求的，学校应当准予毕业并发放毕业证书。
教育部也多次强调，各高校对于已经结束学业并考试合格的毕业生，不得扣发其毕业证书或学位证书。这表明即使存在学费欠缴的情况，学校也不应以此为理由扣押学生的毕业证书。
在实际操作中，部分学校可能会采取一些措施来追讨学费，比如暂扣毕业证书直到费用被补缴。虽然这些做法在法律上是不被支持的，但它们确实发生过。在这种情况下，学生通常会收到一份毕业证明，这份文件在功能上与正式的毕业证书相当，不会影响到学生的就业、考研等。
如果遇到学校因为欠费而扣发毕业证书的情况，学生有权通过以下途径寻求帮助：
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与学校沟通：首先尝试与学校财务部门或教务处进行沟通，了解具体的缴费政策和流程，并尽可能达成一个合理的还款协议。
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向教育主管部门投诉：如果学校坚持不发放毕业证书，学生可以准备相关的证据材料，如学费缴纳记录、学业完成情况等，向当地教育局或教育主管部门提出申诉。
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法律诉讼：作为最后的手段，学生可以通过法律途径解决问题，包括咨询律师，准备充分的证据材料，并向法院提起诉讼。
学校因学费问题扣发毕业证书的行为是不符合法律规定的行为。学生应该积极维护自己的合法权益，同时也要注意履行自己的义务，及时缴纳学费或者按照学校的规定申请缓缴或减免学费。在处理此类问题时，保持冷静和理性是非常重要的，确保所有的行动都在法律框架内进行。
