关于合作医疗住院报销比例，根据搜索结果分析如下：
一、普通住院报销比例
- 报销比例标准
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50% ：合作医疗对住院费用按疾病补偿标准的50%进行报销。
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起付线标准 ：不同级别医疗机构起付线不同，例如：
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乡镇级（一级医院）：200元起付，报销60%；
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县级（二级医院）：500元起付，报销70%；
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市级（三级医院）：700元起付，报销55%。
- 特殊群体优惠
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未成年人/高校大学生 ：起付线为400元；
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大病补偿 ：累计医疗费用超过5000元起，分段补偿比例提高（如5001-10000元65%、10001-18000元70%）。
二、意外伤害报销限制
合作医疗不报销工伤、第三方侵权或自残导致的医疗费用，但可按普通住院报销比例（50%）补偿。
三、报销流程与材料
- 报销流程
出院时由医院直接结算，无需个人垫付；
- 所需材料
包括住院病历、费用清单、诊断证明等。
四、其他说明
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药品/诊疗限制 ：仅限基本医疗保险药品目录内项目；
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异地就医 ：需通过异地就医结算系统办理。
以上信息综合了城镇及农村合作医疗政策，具体比例可能因地区政策差异略有不同，建议参保前咨询当地医保部门。
