罕见病药物未纳入医保的原因主要有以下几点：

1. 患病率低，药物使用人数少： 罕见病的一大特点是患病率极低，通常每种罕见病的患者人数非常有限。由于患者群体小，罕见病药物的市场需求量也很小，这导致制药企业在研发和生产罕见病药物时面临巨大的成本压力。

2. 研发成本高，药物价格昂贵： 罕见病药物的研发成本通常非常高昂，因为需要投入大量的时间、资金和人力资源来开发针对特定罕见病的治疗方法。由于罕见病药物的市场需求量小，制药企业往往难以通过大规模销售来摊销研发成本，从而导致药物价格居高不下。

3. 医保基金承受能力有限： 医保基金的资金来源主要是参保人的缴费和政府的补贴，其目的是为尽可能多的人群提供基本的医疗保障。由于罕见病药物价格昂贵，如果将所有罕见病药物都纳入医保报销范围，将给医保基金带来巨大的财政压力，可能导致医保基金入不敷出，无法可持续地运行。

4. 药物疗效和安全性的不确定性： 一些罕见病药物可能尚未经过大规模的临床试验验证，其疗效和安全性存在一定的不确定性。医保部门在考虑是否将某种药物纳入医保报销范围时，需要综合考虑药物的疗效、安全性、成本效益等因素，以确保医保基金的合理使用。

5. 政策和监管因素： 不同国家和地区对罕见病药物的医保政策和监管要求可能存在差异。有些地区可能已经将某些罕见病药物纳入医保报销范围，而其他地区可能尚未出台相关政策。监管部门对罕见病药物的审批流程也可能影响其纳入医保的速度和范围。

总结：罕见病药物未纳入医保的原因涉及多个方面，包括患病率低、研发成本高、药物价格昂贵、医保基金承受能力有限、药物疗效和安全性的不确定性以及政策和监管因素等。这些因素共同作用，导致罕见病药物的医保覆盖面临挑战。