医保系统升级期间的费用报销需根据具体情况处理，具体流程和注意事项如下：

一、自费结算原则

1. 系统升级期间所有医保业务暂停

   包括住院、门诊、门诊慢特病等直接结算业务，需暂停跨省异地就医直接结算。

2. 已参保但系统未同步的医疗费用需自费

   若在系统升级前已办理入院登记但系统未恢复，或系统升级期间出院，需先全额自费，系统恢复后凭材料补录结算。

二、报销流程

1. 保存完整报销材料

   包括住院发票、费用清单、出院诊断证明、身份证复印件、银行卡复印件等。

2. 系统恢复后补录结算

   • 住院患者 ：出院后联系医保经办机构（如市民之家医保窗口）提交材料办理手工报销。

   • 门诊/药店患者 ：系统恢复后携带发票、药品使用备案表、处方等材料到医保经办机构办理。

3. 特殊情况处理

   • 若系统升级期间已自费且无法补录，需联系参保地医保部门申请手工报销。

   • 门诊慢特病患者需先行支付费用，系统恢复后办理退费及补录手续。

三、注意事项

1. 异地就医备案暂停

   跨省异地就医直接结算暂停期间，需按参保地规定办理手工报销。

2. 系统异常处理

   若因系统对接问题无法报销，需提供医院未直接刷卡的说明及完整就医材料。

3. 药店购药报销

   在系统升级期间通过指定药店购药需先行自费，系统恢复后补录结算。

四、信息查询

• 登录国家医保服务平台APP或当地医保小程序，查看系统停机安排。

• 关注医院公告或医保部门通知，了解具体暂停服务范围及恢复时间。

以上流程和注意事项综合了医保部门官方指引及实际操作案例，确保参保人员能够顺利处理系统升级期间的医疗费用报销问题。