单位连续三个月未缴纳医保，将面临法律处罚并影响职工待遇，具体处理方式如下：

一、法律后果与处罚

1. 行政处罚

   根据《社会保险法》第八十六条，用人单位未按时足额缴纳社保的，由社会保险行政部门责令限期缴纳或补足，并自欠缴之日起按日加收0.5‰的滞纳金；逾期仍不缴纳的，处欠缴数额1倍以上3倍以下的罚款。

2. 刑事责任

   若单位以转移财产、逃匿等方式拒不缴纳社保，可能被移送司法机关依法处理。

二、对职工待遇的影响

1. 医疗费用报销

   • 中断缴费3个月内补缴 ：可累计缴费年限，但中断期间医疗费用由单位承担。

   • 中断缴费超过3个月补缴 ：可补记缴费年限及个人账户，但其他医疗保障待遇（如门诊、住院报销）不予追溯，且从缴费成功次日起设置90日待遇等待期。

2. 其他权益影响

   • 社保缴费年限计算 ：补缴期间不计入缴费年限，但补缴后年限可累计。

   • 滞纳金与罚款 ：单位需承担欠缴金额1%-3%的滞纳金及罚款，可能降低单位信用记录。

三、职工维权途径

1. 要求补缴

   职工可向社保部门或税务部门申请补缴欠费及滞纳金，税务部门负责征收。

2. 医疗费用索赔

   若因单位未缴导致医疗费用自费，可依据《劳动争议调解仲裁法》要求单位赔偿损失。

3. 法律诉讼

   对于拒不履行补缴义务的单位，职工可向劳动仲裁机构申请仲裁，或直接向法院提起诉讼。

四、注意事项

• 补缴时效 ：社保补缴一般需在欠缴行为发生后2年内提出，超过时效可能无法追缴。

• 材料准备 ：补缴需提交单位补缴申请、财务报表、工资发放记录等材料，具体流程可咨询当地社保机构。

建议职工及时与单位协商补缴，避免因长期欠缴导致更大损失。若单位拒绝履行责任，可通过法律途径维护自身权益。