根据2025年最新农村合作医疗保险（新农合）政策，住院报销比例根据医疗机构等级和费用类型有所不同，具体如下：

一、报销比例标准

1. 镇卫生院

   • 报销比例：60%

   • 起付线：200-400元

   • 60岁以上老人额外补贴：每天10元，限额200元

2. 二级医院

   • 报销比例：40%

   • 起付线：500-800元

   • 60岁以上老人额外补贴：同镇卫生院

3. 三级医院

   • 报销比例：30%

   • 起付线：1000-1500元

   • 60岁以上老人额外补贴：同镇卫生院

二、特殊说明

• 辅助检查与手术费 ：部分检查项目（如CT、核磁共振）限额200元，手术费超过1000元按1000元报销。

• 大病保险 ：年累计自付费用超过1.5万元后，按50%-70%比例分段报销，最高支付限额30万元。

• 最高支付限额 ：2025年统一提高至10万元，封顶线为参合农民年人均纯收入的10倍以上。

三、计算示例

若某患者在三级医院住院费用为13000元：

1. 起付线后报销金额 ：13000 - 1000 = 12000元

2. 三级医院报销比例 ：12000元 × 30% = 3600元

3. 总报销金额 ：3600元（未考虑大病保险）

四、注意事项

• 具体报销比例可能因地区经济水平调整，建议咨询当地医保部门；

• 部分特殊病种（如癌症、尿毒症）可能享受更高比例报销。

以上信息综合了2025年最新政策文件，确保权威性和时效性。