腹肌缺如综合征晚期症状主要涉及呼吸、泌尿、消化等多个系统，具体如下：

• 呼吸系统：由于腹肌发育不良，咳嗽时腹压不足，无法有效排出呼吸道分泌物，导致反复呼吸道感染，如肺炎、支气管炎等，严重时可出现呼吸困难、呼吸衰竭。
• 泌尿系统
  • 尿路梗阻：可出现尿道完全性梗阻，出生后即发生肾功能衰竭，即使进行泌尿系手术引流，仍可能少尿，短期内死于尿毒症。部分患者上尿路结构和功能严重损害，尿毒症进展迅速，手术可见输尿管明显扩张、缺乏蠕动，膀胱颈部宽且位置高，收缩排空不良，有大量剩余尿，半数以上病例有重度输尿管返流。
  • 反复感染：因泌尿系统畸形，如肾积水、输尿管扩张等，易导致反复尿路感染，进一步加重肾功能损害。
• 消化系统：可能出现消化不良、便秘或肠梗阻等症状。腹壁肌肉缺失或无力，使腹部对胃肠道的支撑和蠕动功能减弱，食物在肠道内的运输减慢，易引起消化不良和便秘；肠道位置异常或蠕动功能紊乱，可能导致肠梗阻。
• 其他：患者可能存在脐膨出、肠旋转不良等情况。部分患者还可能合并心血管、肌肉骨骼系统、肺发育畸形等，出现相应的症状，如心脏功能异常、骨骼发育畸形等。

由于腹肌缺如综合征是一种先天性疾病，多数患者在儿童期甚至新生儿期就会因严重的并发症而死亡，能存活至晚期的患者较少。