申报退税时需要补缴税款的原因可能包括以下几种情况：
1. 预缴税额低于应纳税额
由于预扣预缴方法的局限性，可能造成预缴税额低于实际应纳税额。比如，纳税人有未依法预扣预缴税款的收入，像讲课费、劳务费等，年度汇算时就需要补缴税款。
2. 收入来源多样
如果纳税人在多个单位任职，或者有多种综合所得，如工资薪金、劳务报酬、稿酬、特许权使用费等，各项收入累加之后，适用的税率可能高于预缴时的税率，从而需要补税。
3. 重复扣除减除费用
要是纳税人在两个及以上单位任职并领取工资薪金，各单位在预缴税款时都扣除了减除费用（每月5000元），导致预缴税额低于实际应纳税额，就需要补税。
4. 税率变化
假如纳税人在年中更换了工作单位，新单位不了解之前的收入情况，可能导致预缴时适用的税率偏低，年度汇算时适用的税率高于预缴税率，这时就需要补税。
5. 年终奖计税方式
如果纳税人在预缴时选择了将多笔年终奖单独计税，而汇算清缴时仅允许一笔年终奖单独计税，其他年终奖需要并入综合所得计税，就可能导致需要补税。
6. 未按规定申报
比如说单位给你申报了5000，你实际收入其实是8000，所以当在年度汇算的时候，肯定是会提示进行补税的。
7. 税务机关的审核
在年度汇算过程中，税务机关可能会对纳税人的申报信息进行详细审核。如果发现申报信息与实际情况不符，税务机关可能会要求纳税人补缴税款。
8. 专项附加扣除或专项扣除填报有误
税款时可能享受了某些扣除项目，如专项附加扣除、专项扣除等。如果在年度汇算时发现纳税人在预缴这些扣除项目不符合规定或计算有误，此时的话经税务审核后可能就需要补税。
以上就是申报退税时需要补缴税款的几种常见原因。如果您在申报过程中遇到需要补缴税款的情况，建议您仔细核对自己的收入和扣除信息，确保申报的准确性。如果有疑问，可以咨询税务机关或专业人士。
