个人所得税的年度汇算清缴过程中，确实可能出现退税反而需要先补缴税款的情况。这种情况通常发生在以下几种情形：

1. 预扣预缴税额不足：如果纳税人在一年中的某些月份或全部月份的收入较高，但预扣预缴的税款低于应纳税额，则在年度汇算时会发现需要补缴税款。

2. 未申报或少申报收入：如果纳税人在年度内有其他收入（如劳务报酬、稿酬等）没有正确申报，导致预缴税款不足，在年度汇算时也需要补缴相应的税款。

3. 专项附加扣除未完全申报：如果纳税人忘记申报或未能完整申报可以享受的专项附加扣除（例如子女教育、继续教育、住房贷款利息等），这可能会导致预缴税款过多或过少。如果是因为后者导致需要补缴税款，那么在补充申报这些扣除后，可能最终还是可以获得退税。

4. 年终奖单独计税或合并计税的选择：根据不同的计税方式选择，计算出的应纳税额会有所不同。如果之前选择了不合适的计税方式，可能会导致预缴税款与实际应纳税额不符，从而需要调整并补缴差额。

在进行年度汇算时，系统会自动计算出全年综合所得的应纳税额，并与已预缴税额进行对比。如果计算结果显示需要补缴税款，纳税人应该按照规定完成补缴后，才能进一步处理退税事宜。不过，如果计算结果是应退税额，则可以直接申请退税而无需补缴。每个纳税人的具体情况不同，因此在办理年度汇算时，应当仔细核对相关信息以确保准确性。