汇算清缴后收到上年发票的处理方式，主要分为会计处理和税务处理两个方面。
会计处理
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以前年度有暂估入账的
- 不需要做账务处理的：如果以前年度暂估入账金额与发票金额一致，且在以前年度已经实际付款等，实际收到发票如果是直接计入成本费用的，是可以不再做账务处理，只需要将该发票粘贴在以前年度做的成本费用凭证后面就可以。
- 需要做账务处理的：
- 存货暂估入账：存货按规定月末暂估入账与月初红冲的，在实际收到发票时按照正常的采购入库做账。
- 固定资产暂估入账：固定资产暂估入账的，如果是暂估金额与实际收到发票有差异的，直接调整固定资产原值，已经计提的折旧费不予调整，后期按照调整后的原值在剩余期限内重新计算折旧额。
- 暂估入库的成本费用金额与发票有差异的：差异金额不大的，先红字冲销暂估入账的会计分录，然后按照发票金额重新做一遍正确金额的成本费用会计分录。如果差异金额较大的，执行《企业会计准则》需要做追溯调整，应通过“以前年度损益调整”科目，调整以前年度的损益以及留存收益等。
- 收到发票并付款的：应先红字冲销暂估分录，或直接冲减“应付账款”等负债科目，贷记“银行存款”，发票就附在付款凭证后面。
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以前没有暂估入账的
- 以前年度实际发生的，但是会计核算暂估入账的，属于会计差错。执行《企业会计准则》的，金额较为重大的，应做追溯调整；执行《小企业会计准则》的，对于会计差错采用“未来适用法”，即直接计入当期。
税务处理
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不做处理的
- 如果该发票对应的成本费用，在以前年度已经通过暂估入账的形式，计入了损益，且企业所得税汇算清缴时也没有做纳税调增的，在实际收到发票时只要没有金额差异，就不需要特别处理。
- 如果发票对应的费用是资本化的，比如计入“在建工程”等，没有企业所得税缴纳产生影响的，实际收到发票后，也不需要处理。
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需要处理的
- 可以追补扣除：如果企业因为收到发票而在汇算清缴时已经做了纳税调增的，在汇算清缴后才实际收到发票的，可以按规定进行追补扣除，应做专项申报，然后申请退税或抵税等。
- 需要补税的：如果通过暂估入账形式计入且汇算清缴没有做纳税调增，但是实际收到的成本费用发票金额小于暂估金融，造成税前多扣除和少缴税款的，法理上应及时去更正申报，然后补缴税款，并从滞纳之日计算缴纳滞纳金。如果企业不去更正申报并补税的，税务局以后稽查发现，一样会要求企业并缴纳滞纳金，构成偷税的，还会有补税金额0.5倍-5倍的罚款。
总结
汇算清缴后收到上年发票的处理，需要根据具体情况进行分析，包括发票的性质（费用、存货、固定资产等）、是否已经暂估入账、发票金额与暂估金额的差异等。在会计处理上，需要根据会计准则进行相应的调整；在税务处理上，需要根据税法规定进行相应的纳税调整。如果有疑问，建议咨询专业的会计师或税务师。
