孕妇请病假超过三个月的处理方式涉及法律规定、公司政策、员工权益等多方面。以下是一些具体的建议和步骤，帮助公司和员工在这种情况下的沟通和解决问题。

法律规定

医疗期规定

根据《劳动合同法》和相关劳动法规，孕妇享有特定的医疗期，即在孕期、产期和哺乳期内，用人单位不得解除劳动合同。医疗期的长度根据员工在实际参加工作年限和在本单位工作年限来确定，最少为三个月。
医疗期的规定为员工提供了法律保护，确保他们在特定情况下能够享有休假权利。医疗期并不意味着疾病治愈期，员工在医疗期满后仍需休病假的，公司需依据具体情况处理。

病假工资规定

病假期间的工资标准根据员工的工龄和病假时间而定。通常情况下，病假工资不低于当地最低工资标准的80%。具体标准如下：

• 连续工龄不满2年的，按本人工资的60%计发。
• 连续工龄满2年不满4年的，按本人工资的70%计发。
• 连续工龄满4年不满6年的，按本人工资的80%计发。
• 连续工龄满6年不满8年的，按本人工资的90%计发。
• 连续工龄满8年及以上的，按本人工资的100%计发。
  病假工资的规定确保了员工在病假期间的基本生活需要得到保障，同时也为企业提供了合理的经济补偿。

处理步骤

提交病假申请及相关证明

孕妇应及时向用人单位提交病假申请及相关医疗证明，如诊断证明、病历等，以证明其确实需要病假。这是确保病假合理性和合法性的基础步骤，有助于避免后续的纠纷。

公司内部评估

用人单位应根据其内部的规章制度来评估病假的合理性和合法性。可能会要求孕妇定期提交复查报告等。公司内部的评估机制有助于确保病假申请的合理性和透明度，防止滥用病假的情况发生。

与员工沟通协商

如果孕妇的病假确实需要延长，应与用人单位进行沟通协商，寻求双方都能接受的解决方案。沟通协商是解决问题的关键，既能保障员工权益，又能减少公司的运营压力。

沟通与协商

提供必要医疗信息

孕妇应积极配合用人单位的要求，提供必要的医疗信息，如定期复查结果等。提供详细的医疗信息有助于公司全面了解员工的病情，做出更合理的决策。

探讨灵活工作安排

用人单位可以考虑孕妇的特殊情况，安排灵活的工作时间或减少工作量，以适应其身体状况。灵活的工作安排不仅能保障员工的健康，还能减少对公司运营的影响，实现双赢。

法律途径

向劳动监察部门投诉

如果公司不同意继续请假，孕妇可以向劳动监察部门投诉或选择劳动仲裁途径解决争议。法律途径是保障员工权益的最后一道防线，但在采取法律行动前，应尽量通过协商解决问题。

劳动仲裁和诉讼

如果协商无果，孕妇可以申请劳动仲裁或向法院提起诉讼，维护自己的合法权益。劳动仲裁和诉讼是解决劳动纠纷的重要手段，但应作为最后的选项，因为诉讼过程可能较为复杂和漫长。

孕妇请病假超过三个月的处理需要综合考虑法律规定、公司政策和员工实际情况。通过提交病假申请、公司内部评估、沟通协商以及必要的法律途径，可以有效解决这一问题，维护双方的合法权益。