医保和合作医疗不是同一种制度，二者在覆盖人群、缴费方式、报销范围等方面存在显著差异。关键区别在于：医保主要面向城镇职工和居民，具有强制性且保障水平较高；合作医疗（如新农合）则针对农村人口，以自愿参与为主，报销范围和比例相对有限。
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覆盖对象不同
医保分为职工医保和居民医保，覆盖城镇就业人员及非就业居民；合作医疗专为农村户籍人群设计，需以家庭为单位整户参保。 -
缴费标准与方式
职工医保由单位和个人按工资比例共同缴纳，居民医保按年固定缴费；合作医疗则采取个人自愿缴费+政府补贴模式，金额通常低于医保。 -
报销范围与比例
医保报销范围更广，涵盖门诊、住院及特殊病种，比例可达70%-90%；合作医疗侧重大病统筹，门诊报销受限，比例普遍低于医保。 -
管理机制
医保由社保系统统一管理，支持异地结算；合作医疗由卫生部门主导，报销多限于本地医疗机构。 -
政策趋势
部分地区已合并城乡居民医保与新农合，逐步统一待遇，但职工医保仍保持独立体系。
总结：根据户籍和职业选择参保类型，避免重复缴费。若条件允许，优先选择保障更全面的医保；农村居民可关注当地政策是否已实现城乡医保并轨。
