关于合作医疗（新农合）的缴费与社保卡的关系，综合权威信息整理如下：

一、缴费方式与账户关系

1. 缴费渠道

   合作医疗的缴费通常通过村集体组织、乡镇政府或第三方机构收取，缴费金额不直接存入社保卡。社保卡本身是社会保障卡，主要用于城镇职工社保（养老、医疗、失业等）的记录和结算。

2. 账户独立性

   新农合有独立的个人账户，缴费后资金进入新农合专用账户，与城镇职工社保账户分开管理。两者资金不混同，社保卡不会直接显示新农合账户余额。

二、与社保卡的功能差异

1. 功能定位

   • 社保卡 ：整合城镇职工社保（养老、医疗等）及金融功能，支持全国通用，可就医结算、金融交易等。

   • 合作医疗卡 ：仅限农村地区使用，用于医疗保障报销，功能单一。

2. 使用范围

   社保卡全国通用，而合作医疗通常限定户籍所在地使用，异地就医需额外办理转诊手续。

三、特殊情况说明

• 新农合与社保合并 ：部分地区已实现城乡居民医保（含原新农合）与职工社保的合并，缴费后统一计入社保卡，但两者待遇仍需分别享受。需注意当地具体政策，不同地区合并进度不同。

• 重复参保问题 ：我国现行政策禁止重复参保，若已参加职工社保，则不能再参加新农合，反之亦然。

四、查询方式

合作医疗缴费记录可通过以下方式查询：

1. 线上平台 ：通过当地社保局官网或官方APP查询缴费明细。

2. 线下渠道 ：到乡镇社保经办机构或村集体组织查询。

总结

合作医疗的缴费不直接存入社保卡，两者分属不同制度，资金和管理均独立。若需了解具体操作或政策，建议咨询当地社保部门。