农村合作医疗与北京社保（职工医保）存在政策冲突，具体表现如下：

一、核心冲突点

1. 待遇享受互斥性

   根据《中华人民共和国社会保险法》第二十四条和第六十六条规定，新型农村合作医疗（新农合）与职工基本医疗保险属于 不可同时享受的医疗保障 。参保人员若同时参加两者，将无法获得任何医疗费用报销。

2. 报销规则限制

   • 若已参加职工医保，再参保新农合将导致原有医保失效，需办理注销手续。

   • 报销时需提供原始发票，且每个医疗费用仅能报销一次，无法重复享受。

二、政策建议

1. 优先选择职工医保

   职工医保的报销范围更广，包括门诊、住院等更多项目，且待遇水平（如起付线、报销比例）通常高于新农合。

   • 若已在北京长期工作并参保职工医保，建议停掉新农合，避免重复缴费。

2. 特殊情况处理

   • 若因户籍或居住原因需继续参加新农合（如未就业、流动人口等），需先解除职工医保，但需承担职工医保的缴费责任。

   • 商业医疗保险与社保、新农合不冲突，可叠加购买。

三、其他注意事项

• 缴费年限累计 ：职工医保缴费年限连续计算，断缴可能影响退休后的养老金待遇；新农合断缴2年以上将失去报销资格。

• 转移接续 ：职工医保支持跨地区转移接续，但新农合需在户籍地办理注销或转移手续。

建议根据自身实际情况选择参保方案，避免因政策冲突影响医疗保障权益。