关于男性生育津贴与农村合作医疗（农合）的报销问题，综合相关法律规定和搜索结果，说明如下：

一、基本政策冲突

1. 参保资格不同

   男性无法参保生育保险，而农合是针对农村居民的医疗保障制度，两者参保对象和缴费标准存在本质差异。

2. 报销待遇性质差异

   • 生育保险 ：属于职工医保体系，提供生育医疗费用和生育津贴，适用于城镇职工。

   • 农合 ：属于新型农村合作医疗，主要用于报销医疗费用，不提供生育津贴。

二、具体报销规则

1. 男性生育保险的适用情形

   • 用于支付已参保女职工的生育或流产医疗费用。

   • 可享受带薪陪产假。

2. 农合的适用情形

   • 仅能报销男性参保者本人的医疗费用，无法用于报销配偶的生育费用。

3. 两者不可同时使用

   • 由于报销需提供费用票据原件，且社保系统无法同时认可两种保险，因此存在直接冲突。

三、处理建议

• 优先选择生育保险 ：若女性职工已参保生育保险且符合领取条件，应优先选择生育津贴以获取经济补偿。

• 医疗费用不足时的补充选择 ：若生育费用较高且女性未参保或参保待遇不足，可咨询当地医保部门，看是否可通过其他方式（如家庭共济、商业补充保险等）弥补差额。

• 放弃农合的注意事项 ：若选择生育保险，需放弃农合报销资格，且医疗费用需通过生育保险渠道申请，无法退还已报销部分。

四、法律依据

根据《中华人民共和国社会保险法》第五十三条和第五十四条规定：

• 生育保险待遇由用人单位缴纳生育保险费，职工不缴纳；

• 用人单位缴纳生育保险的，其职工享受生育保险待遇；职工未就业配偶可享受生育医疗费用待遇。

男性生育津贴与农合存在政策冲突，需根据实际情况选择适用险种。