单位缴纳的医保费用存在差异，主要原因如下：

一、缴费基数差异

1. 按职工工资总额缴纳

   单位医保缴费以单位工资总额为基数，不同单位、不同岗位的工资水平差异会导致单位缴费金额不同。

2. 地区政策与基数标准

   各地社保部门公布的职工社会平均工资或当地经济水平不同，单位可能按此标准计算缴费基数。例如，某地若按社平工资的16%比例缴费，而职工实际工资仅社平工资的8%，则单位缴费基数会高于职工实际工资。

二、缴费比例差异

1. 单位缴费比例较高

   职工医保中，单位缴费比例通常为工资总额的6%-16%（如上海为9%+2%），而个人仅缴纳2%。即使缴费基数相同，单位缴费金额仍显著高于个人。

2. 特殊缴费比例现象

   部分中小企业可能因成本控制按社平工资的16%比例缴纳单位缴费，职工个人按8%比例缴费，导致单位缴费基数与个人缴费基数相同，但实际金额仍高于职工工资。

三、账户划分差异

单位缴纳的8%费用直接进入统筹账户，用于支付住院、大额医疗费用等；个人缴纳的2%进入个人账户，用于门诊、药店购药等小额支出。由于统计口径不同（个人账户显示金额 vs 总缴费金额），会出现余额与缴费不一致的情况。

总结

单位医保费用差异主要源于缴费基数和比例的不同，同时受到地区政策、企业用工形式等因素影响。职工若对缴费金额有疑问，建议咨询单位人事部门或当地社保机构。