根据现有信息，海南藏族自治州各县海拔高度排名如下（综合地形数据及主要城市海拔）：
一、整体概况
海南藏族自治州全州平均海拔3000米以上，地势西北高、东南低，地形以山地为主，高原丘陵和河谷台地相间。全州最高海拔5305米（根尔岗），最低海拔2168米。
二、各县海拔排名
- 兴海县
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最高点 ：阿尼玛卿雪山（6282米）
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县城 ：子科滩镇（约3200米）
- 同德县
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最高点 ：玛哈赞普神山（4400米）
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县城 ：尕巴松多镇（约3200米）
- 共和县
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最高点 ：恰卜恰镇（约3200米）
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县城 ：恰卜恰镇（同级别）
- 贵德县
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最高点 ：黄河南岸景区（约2200米）
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县城 ：贵德镇（约2300米）
- 五指山市
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最高点 ：黎母山（1412米）
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市区 ：通什河两岸（约328米）
三、补充说明
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五指山市 虽被部分资料列为“海南海拔最高的城市”，但实际其最高点为黎母山，属于海南岛中部山脉，并非整个州最高。
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海南藏族自治州 包含海南岛及青海湖部分区域，若仅考虑海南岛部分，五指山市、保亭县、琼中县等海拔较高。
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以上数据综合自地形特征、旅游景点及政府公开信息，具体数值可能存在细微差异。
