农村合作医疗卡不会每年清零 。从2018年开始,农村合作医疗开设了个人社保账号,并办理了社保卡。这意味着农村合作医疗费用当年有剩余的话,可以结转到下一年继续使用。如果哪年断交农村合作医疗,如果接着再交农村合作医疗必须补交上一年的农村合作医疗费用,其所交的费用包括个人部分以及国家补贴的部分。此外,医保卡里的钱是个人账户的钱,一般来说只有城镇职工医保才会有个人账户。这部分钱是归属个人所有的,并且没有时间的限制。医保卡里面的钱可以累计计算,可以用来支付符合规定的医疗费用。
因此,农村合作医疗卡内的余额会累积到下一年,不会因年度而清零。不过,如果参保人中断了医疗保险费用,医保卡的功能会停用,但医保卡账户余额不会被清零。需要注意的是,新型农村合作医疗是每年缴纳,当年的保险只适用于当年的医保报销,所以没有必要补交。但是第二年的合作医疗要记得提前缴纳,因为有等待期。