王凤君离开北元化工的原因并未在公开资料中明确提及，但可以从他的职业经历和北元化工的发展情况推测出一些可能的原因。

王凤君的职业经历

• 创业背景：王凤君于1989年放弃神木县单位的工作，来到神木县水泥厂创业，随后又涉足电厂和电石项目。2001年，他发现榆林有丰富的煤和盐资源，决定建设聚氯乙烯项目，并于2003年5月开工建设，建成了陕北首个聚氯乙烯装置。
• 在北元化工的角色：王凤君在推动北元化工上市过程中发挥了重要作用。2007年，他拉上当地十位民营企业家的合作，筹集股本10亿元，并与陕煤集团合作，建设了全国最大的年产100万吨聚氯乙烯循环综合利用项目，形成了后来的“北元模式”。

北元化工的发展情况

• 上市过程：北元化工在2020年10月20日正式在上海证券交易所挂牌上市，成为榆林首家上市公司。
• 管理层变动：在王凤君辞去北元化工总经理职务后，北元化工的上市进程推进速度有所放缓。

可能的原因

1. 管理层变动：王凤君在2014年5月辞去北元化工总经理职务，这可能是由于内部管理层变动或战略调整的需要。
2. 个人职业规划：王凤君在离开北元化工后，继续在企业管理、战略咨询等领域发挥自己的才能，可能找到了更适合自己职业发展的方向。

虽然无法确定王凤君离开北元化工的具体原因，但从他的职业经历和北元化工的发展情况来看，可能是由于内部管理层变动或个人职业规划等多种因素共同作用的结果。