肾结石微创手术的弊端主要表现在以下几个方面：
一、碎石的效率较低，不管是经皮肾镜碎石术，还是输尿管软镜碎石，都是将比较大的结石击碎，然后服用排石药物将结石排出。与开放手术取石相比较，碎石的效率是比较低的；
二、碎石手术中所使用的设备比较昂贵，所以费用较高。针对肾结石的微创手术，通常需要选择专业的设备，这些设备价格较高，致使手术费用过高，会给患者造成一定的经济负担。
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