关于新农合报销后的发票处理，具体说明如下：

一、发票留存地点

1. 医院开具

   • 住院费用发票通常由医院在出院时直接开具，患者可现场获取两联：一联由患者留存，一联由医院留存用于医保报销。

   • 若采用医保卡直接结算，结算收据由医院提供。

2. 医保中心开具

   • 对于个人垫付的医疗费用，需前往医保中心办理报销，报销后由医保中心出具分割单或审核单。

二、发票重要性

• 报销必需 ：新农合报销需提供原始发票作为主要凭证。

• 二次报销依据 ：部分地区的门诊或自费部分可申请二次报销，需提供医保中心开具的分割单。

三、特殊情况处理

1. 发票丢失

   • 若发票丢失，需联系医保局说明情况，部分情况下可补打，但需承担额外费用。

   • 若已通过商业险报销，需向医保局提供医疗费用明细等材料申请二次报销。

2. 重复报销风险

   • 同一费用不可重复报销，需确保所有报销渠道符合补偿性原则，剩余自费部分可后续处理。

四、建议流程

1. 出院时 ：核对发票信息，确保与住院记录一致，保留好医院开具的任何分割单或审核单。

2. 二次报销 ：每年年底前携带发票原件（或分割单）、身份证、户口本等材料到社区或乡镇医保机构办理。

3. 查询进度 ：通过当地社保局官网、12333热线或线下服务大厅查询报销进度。

以上信息综合了不同地区的政策规定，具体操作请以当地最新政策为准。