云南新农合住院报销比例根据医疗机构级别不同，范围在30%-90%之间，其中乡镇卫生院最高可达90%，三级医院最低约30%-45%。 具体报销比例受费用区间、地区政策及特殊群体身份影响，全年累计住院补偿封顶线通常为1.5万-25万元，大病保险可进一步叠加报销。
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医疗机构级别差异：乡镇卫生院报销比例最高（60%-90%），县级医院约65%-80%，州级/省外医院为60%-65%，三级医院因起付线较高（800-1000元）报销比例降至30%-45%。部分政策对转诊患者有额外限制，未转诊者报销比例降低10%-20%。
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费用分段补偿：多数地区采用分段计算，例如县级医院500元以下报销25%，500-1万元报销65%，超1万元部分报销50%。乡镇卫生院300元以下报销30%，300-2000元报销70%，超2000元报销50%。
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特殊群体优待：农村低保户、五保户等免起付线，报销比例提高5%-15%；连续参保3-5年者，大病报销额度增加4000元/年，住院比例最高可达85%-95%。孕产妇住院分娩享受单次定额补偿400元。
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大病保险叠加：基本医保报销后，自付超1万元部分可申请大病补助，1-3万元补25%，3万元以上补50%，与基本医保合计报销可达人均收入6倍以上，年封顶线25万元。
总结提示：实际报销需结合当地政策细则，建议优先选择乡镇或县级定点医院，并办理转诊手续以最大化比例。参保人员可通过“云南省电子税务局”公众号查询实时报销标准或向医保局咨询个性化情况。
