重复报销打款是违法行为，且通常会被发现。以下是具体分析及防范建议：

一、重复报销的违法性

根据《中华人民共和国刑法》第二百零一条规定，纳税人采取欺骗、隐瞒手段进行虚假纳税申报或不申报，逃避缴纳税款数额较大且占应纳税额百分之十以上的，将面临三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。虽然发票重复报销不直接涉及税款问题，但属于财务违规行为，可能引发税务审查。

二、重复报销的审计发现风险

1. 系统关联验证

   若企业使用与税务系统关联的报销系统，重复发票号将无法通过系统录入，财务人员会通过发票编码、金额等校验规则发现异常。

2. 人工审核机制

   即使系统未拦截，财务人员在对报销单据进行二次审核时，仍可能通过对比历史记录、发票内容一致性等手段发现重复。

3. 专项审计与随机抽查

   定期内部审计或外部审计可能涉及发票真实性核查，重复报销行为难以长期隐藏。

三、重复报销的防范措施

1. 完善发票管理系统

   • 使用电子发票登记系统，实现发票信息的实时登记与共享，避免重复录入。

   • 开启发票防伪查询功能，报销前需验证发票真伪。

2. 规范报销流程

   • 制定严格的报销审批制度，明确责任人与审核权限，减少人为操作失误。

   • 分支机构间建立发票信息同步机制，防止因数据不同步导致的重复报销。

3. 强化财务人员培训

   • 定期开展财务规范培训，提高对发票审核重要性的认识，避免因疏忽导致重复报销。

四、案例警示

某公司员工通过修改发票号码等手段累计重复报销5万元，最终在内部审计中被发现，涉事人员面临法律责任。此类案例表明，重复报销行为若被查，不仅会导致财务损失，还会对相关责任人产生法律制裁。

重复报销打款存在较高被发现风险，企业应通过技术手段和管理措施有效防范。