关于合作医疗不交是否影响社保的问题，需结合社保类型和地区政策具体分析：

一、合作医疗与社保的关系

1. 制度性质不同

   合作医疗（如新农合）与社保中的医疗保险是两种独立制度，前者是自愿参加的医疗保障，后者是强制性的社会保险。

2. 缴费与待遇的关联性

   • 医疗保险 ：未缴纳则无法享受医保报销待遇（如门诊、住院等），且连续中断超过3个月可能影响缴费年限。

   • 合作医疗 ：未缴纳则无法享受其提供的医疗保障，但不会影响社保中其他险种（如养老、失业等）的缴纳。

二、具体影响分析

1. 医疗保险待遇影响

   • 无法使用医保报销门诊、住院等医疗费用，需自费。

   • 连续参保时间不足12个月时，门诊大病报销比例降低（60%→75%→90%）。

   • 缴费年限中断超过3个月可能导致退休后待遇降低或停发。

2. 社保其他险种影响

   • 不影响五险一金中的养老保险、失业保险、工伤保险和生育保险的缴纳与待遇。

3. 其他限制

   • 无法使用社保卡在定点药店购药，药品费用需自费。

三、处理建议

1. 补缴合作医疗

   若因缴费问题影响医疗需求，可咨询当地医保部门补缴手续，部分地区允许补缴后恢复待遇。

2. 选择合适保险

   根据经济状况和医疗保障需求，选择社保或合作医疗。若经济条件允许，可同时参保以获得更全面的保障。

3. 关注政策差异

   不同地区对社保断缴政策存在差异，建议咨询当地社保机构了解具体规定。

合作医疗不交会影响医疗保险待遇，但不会直接影响社保中其他险种的缴纳。建议根据自身情况合理规划参保方案。