安徽医保在南京可以报销，但需根据参保类型和就医类型办理相关手续。以下是具体说明：

一、异地就医报销的可行性

安徽医保支持异地就医报销，但需提前办理异地就医备案手续。目前安徽与江苏两省已实现医保异地就医直接结算，参保人员持社会保障卡或电子医保凭证即可刷卡结算。

二、报销比例与条件

1. 报销比例

   • 省内异地 ：报销比例约为60%；

   • 省外非定点医院 ：起付线1000元，报销比例最低45%。

2. 报销范围

   • 仅限住院费用报销，门诊治疗不参与报销；

   • 需提供身份证、诊断证明、出院记录、新农合证或医保凭证等材料。

三、办理流程与注意事项

1. 备案手续

   • 通过“安徽医保公共服务”微信公众号或“国家医保服务”APP办理异地就医备案；

   • 部分城市（如南京）支持电话备案，需提供就医医院信息。

2. 就医要求

   • 需选择南京的定点医疗机构就医，非定点医院可能影响报销比例或不予报销；

   • 门诊费用需符合参保地门诊报销政策（如村卫生室60%、镇卫生院40%等）。

3. 其他费用

   • 自费部分（如起付线、封顶线）需自行承担。

四、特殊情况处理

• 若未提前备案，可能无法直接结算，需先垫付费用后返回安徽报销；

• 新农合与城镇居民医保需分别办理备案，两者政策不同。

建议办理异地就医备案后，通过官方渠道确认最新政策，以确保顺利结算。