2025年在上海治疗腹痛伴腹泻的医院选择上，可以参考以下几家医院，它们在消化系统疾病、腹痛和腹泻的诊治方面具有较高的专业水平和丰富的经验：

1. 复旦大学附属华山医院
   华山医院在消化内科、感染科等领域具有很强的专业能力，尤其擅长处理腹痛伴血便等复杂症状。其先进的手术室环境和术后护理服务也得到了广泛认可。

2. 上海交通大学医学院附属瑞金医院
   瑞金医院是三级甲等综合性医院，其消化内科和胃肠外科在国内外享有盛誉。瑞金医院的医疗团队技术力量雄厚，能够提供全面的诊断和治疗服务。

3. 上海市第一人民医院
   这是一家历史悠久的大型综合性医院，其消化内科在处理各种类型的腹泻及相关并发症方面积累了丰富的经验，是患者治疗腹痛伴腹泻的优选之一。

4. 上海长海医院
   长海医院在消化系统疾病治疗方面具有很高的声誉，尤其擅长处理功能性胃肠病、炎症性肠病等疾病。其普外科和消化内科在腹痛伴腹泻的诊治中表现突出。

5. 上海中医药大学附属龙华医院
   龙华医院以中西医结合的方式治疗腹痛症状见长，尤其注重脏腑功能协调平衡，适合希望采用中医调理的患者。

6. 上海嘉定区中心医院
   对于术后腹痛或腹泻患者，嘉定区中心医院消化内科提供了专业的诊疗建议，尤其适合术后恢复期的患者。
   

7. 上海中佑肛肠医院
   作为一家专注于肛肠疾病的专科医院，中佑肛肠医院在治疗腹泻、便秘及相关并发症方面具有显著优势，尤其适合因肠道问题引起的腹痛伴腹泻患者。

8. 上海嘉会医院
   嘉会医院提供全面的健康体检、预防保健和康复护理服务，对于慢性腹泻患者，可以通过大便常规、肠镜检查等手段明确病因。

根据患者的具体病情（如是否伴有血便、术后恢复情况等），可以选择上述医院中的某一家进行诊治。建议患者提前了解医保政策覆盖范围，并根据自身需求选择合适的医院。在就医过程中注意饮食调整，避免辛辣刺激性食物，以减轻症状。