自身免疫性疾病如果不及时治疗，可能会导致以下严重的后果：

1. 活动能力受限：自身免疫性疾病如类风湿性关节炎、系统性红斑狼疮等，会攻击关节和肌肉，导致关节疼痛、肿胀和僵硬，严重时可能导致关节变形和功能丧失，影响患者的日常生活和工作能力4。

2. 肝肾功能损伤：某些自身免疫性疾病如自身免疫性肝炎、系统性红斑狼疮等，会攻击肝脏和肾脏，导致炎症和组织损伤，严重时可能导致肝功能衰竭、肾功能不全，甚至危及生命4。

3. 神经功能障碍：自身免疫性脑炎等疾病会攻击神经系统，导致脑组织损伤，如果不及时治疗，可能会产生不可逆性的神经功能障碍后遗症，如意识障碍、认知功能下降、运动障碍等，严重影响患者的生活质量5。

4. 全身多器官损害：系统性自身免疫病如系统性红斑狼疮、硬皮病等，由于抗原抗体复合物广泛沉积于血管壁等原因，会导致全身多器官损害，包括心脏、肺部、消化系统等，严重时可能导致多器官功能衰竭8。

5. 生活质量下降：自身免疫性疾病的症状如疲劳、疼痛、皮肤病变等，会给患者带来身体和心理上的痛苦，严重影响患者的生活质量7。

6. 死亡率增加：自身免疫性疾病如系统性红斑狼疮、血管炎等，如果不及时治疗，可能会导致严重的并发症，如感染、血栓形成等，增加患者的死亡率6。

对于自身免疫性疾病，早期诊断和及时治疗非常重要，可以有效控制病情，减轻症状，改善患者的生活质量，并降低并发症的风险。