根据您描述的情况，医保通过支付宝缴费但余额显示为0，可能由以下原因导致：

一、账户类型与缴费标准

1. 城乡居民医保无个人账户

   若您缴纳的是城乡居民医保，该险种本身不设立个人账户，因此无法有余额显示。

2. 灵活就业人员低档缴费

   以灵活就业身份参保且选择低档（如缴费比例4%）时，个人账户不建立，自然无余额。

二、账户余额使用情况

1. 医疗费用已报销

   若个人账户中的医疗费用已通过医保报销，账户余额可能被抵销至0。

2. 账户初始无余额

   新参保人员首次缴费后，个人账户需经过一定时间（如每月7-15日）的划账才会显示余额，期间可能显示为0。

三、政策与系统因素

1. 医保政策调整

   极少数情况下，医保政策变动可能导致个人账户余额清零，但这种情况概率极低。

2. 系统延迟或错误

   医保账户信息更新滞后（如每日/每周未同步）或银行/医保系统操作错误，可能导致显示异常。

四、其他可能原因

• 银行账户混淆 ：若通过银行渠道缴费，余额显示为0可能源于对社保账户与银行账户的混淆。

• 缴费未成功 ：部分缴费操作未成功，但系统未及时更新账户状态。

建议处理方式

1. 核对账户类型

   确认是否为职工医保（有个人账户）或城乡居民医保（无个人账户）。

2. 检查缴费记录

   查看近期的医疗费用报销情况，确认是否存在已报销但未到账的记录。

3. 联系医保部门

   若怀疑系统问题或账户信息错误，可通过医保官方渠道（如深圳市医疗保障局APP）查询或申诉。

4. 避免混淆查询

   医保账户与银行账户需分别查询，使用正确的APP或渠道核实账户状态。

若以上方法仍无法解决，建议提供具体参保类型和缴费记录，进一步分析原因。