关于农村申请旧房翻新建房的收费标准，综合相关政策和搜索结果，主要涉及审批费用、施工费用及可能的其他支出，具体如下：

一、审批费用

1. 审批手续费

   仅收取几十元至100元，用于办理宅基地使用审批手续。

2. 其他费用

   • 土地证书工本费：5元/户。

   • 若涉及新增宅基地，需缴纳耕地开垦费或补充耕地指标。

二、施工费用（按装修档次划分）

1. 基础装修（简装）

   • 价格范围：600-800元/平方米，包含水电改造、基础铺砖、墙面处理等。

2. 中等装修（中装）

   • 价格范围：800-1000元/平方米，增加衣柜、橱柜等定制家具。

3. 精装

   • 价格范围：1000-1200元/平方米，含环保材料、设计感强的装修。

三、其他可能支出

1. 拆改费用

   • 普遍在50-100元/平方米，需注意承重墙保护。

2. 水电改造

   • 包含管线更新，费用约55-65元/平方米，建议选择10年质保服务。

3. 墙面/地面翻新

   • 复合木地板约120元/平方米，实木地板300元以上，踢脚线50-70元/平方米。

4. 吊顶翻新

   • 简单刷漆约6000-9000元，全包需额外预算。

四、注意事项

1. 政策差异 ：具体费用因地区政策、房屋面积及装修标准不同而有所差异，建议咨询当地政府或相关部门。

2. 合规要求 ：旧房翻建需符合《土地管理法》和《城乡规划法》规定，违规操作可能导致补贴无法申请。

3. 费用核查 ：施工前应明确施工队资质，避免隐性收费，保留合同条款。

以上费用为综合估算，实际支出需结合当地市场行情和具体项目需求确定。