在线上办理药品经营许可证的流程通常包括以下几个步骤：

一、申请条件

1. 合法注册的公司：申请者必须是合法注册的公司，所有药品经营相关的资质必须合法且完整4。
2. 专业人员：必须拥有至少两名具备药品或医疗器械管理法律、法规及专业知识的人员，或持有相应资格认定的技术人员4。
3. 信息安全措施：需建立措施，确保药品信息的合法性、真实性和安全性4。

二、提交材料

1. 申请表：填写完整的申请表4。
2. 营业执照：提供企业营业执照复印件（新成立企业需提供名称预核准通知书及相关文件）4。
3. 网站相关证明：网站域名注册证书或相关证明文件，网站栏目设置说明，操作说明等4。
4. 专业人员证明：药品及医疗器械专业技术人员的学历证明或资格证书复印件，以及网站负责人的身份证复印件和简历4。
5. 保障措施说明：健全的保障措施说明，保证药品信息合法性的声明，承诺书，《授权委托书》等4。

三、申请流程

1. 网上填报：登录国家食品药品监督管理总局行政事项受理服务页，“新建申请”进行网上填报公司基本信息2。
2. 准备材料：根据各省市食品药品监督管理部门的要求，准备申请材料2。
3. 提交材料：根据要求，选择网上申报或窗口提交申请材料2。
4. 受理决定：相关部门在收到申请材料之日起5个工作日内会做出受理与否的决定，并通知申请人2。
5. 审核审批：自受理之日起20日内，相关部门会对申请材料进行审核，并作出同意或者不同意的决定2。
6. 证书发放：同意的，核发证书，同时报国家食品药品监督管理总局备案并发布公告；不同意的，会书面通知申请人并说明理由2。

四、注意事项

1. 政策变动：由于政策可能会有所变动，建议在办理前咨询当地药品监督管理部门以获取最新的办理指南和要求8。
2. 材料真实性：确保提交的申请材料齐全、真实、准确5。
3. 专业人员：确保公司名下有两名药学专业毕业的人员8。
4. 网站合规性：确保公司有相关业务的网站，并且服务器协议要标明在本省8。

以上就是在线上办理药品经营许可证的一般流程和注意事项，具体细节可能会因地区和政策的不同而有所差异，建议在办理前详细咨询相关部门。