根据搜索结果整理，2025年福建福州治疗月经不调的主要医院如下：

一、三甲公立综合医院

1. 福建医科大学附属第一医院
   • 妇科诊疗经验丰富，拥有专业医疗设施，擅长妇科内分泌疾病和月经不调的综合治疗。
2. 福建医科大学附属协和医院
   • 妇科口碑良好，诊疗设备完善，设有生殖内分泌相关科室。
3. 福建省立医院
   • 综合实力强，妇科为重点科室之一，提供中西医结合治疗方案。

二、三甲公立专科医院

1. 福建省妇幼保健院
   • 全国首批三级甲等妇幼保健院，妇科和内分泌科专业性强，擅长月经不调、多囊卵巢综合征等诊疗。
2. 福州市妇幼保健院
   • 妇科疾病诊疗体系完善，尤其关注女性生殖健康问题。

三、中医医院

1. 福建中医药大学附属人民医院
   • 以中医调理为特色，通过中药、针灸等方式治疗月经不调，适合需长期调理的患者。
2. 福州市中医院
   • 设有妇科重点专科，擅长中西医结合治疗月经紊乱及相关并发症。

四、专科/民营医院

1. 福州国德医院
   • 妇科诊疗中心专注月经不调、内分泌失调等疾病，提供个性化治疗方案。
2. 福州博爱中医院
   • 以生殖健康为重点，擅长月经不调与不孕不育的综合管理。

选择建议

• 公立医院：优先考虑福建省妇幼保健院、福建医大附属第一医院等，综合实力强且医保覆盖全。
• 中医调理：若需长期调理或对西药敏感，可选福建中医药大学附属人民医院。
• 专科医院：如福州国德医院，适合需要针对性治疗或私密性较高的患者。

建议结合个人病情、医保情况及就诊便利性选择，并提前通过医院官网或电话确认科室排班。更多完整信息可参考各医院官网或上述搜索结果链接。