灵活就业人员选择100%档和60%档缴纳社保时，主要区别体现在缴费比例、养老金待遇、医疗待遇及其他相关权益上。以下是具体对比分析：

一、缴费比例差异

• 灵活就业100%档 ：按当地社会平均工资的 20% 缴费；

• 灵活就业60%档 ：按当地社会平均工资的 12% 缴费。

二、养老金待遇差异

由于缴费基数和年限的差异，100%档的养老金待遇显著高于60%档。具体表现为：

1. 基础养老金 ：100%档基础养老金更高；

2. 个人账户养老金 ：按相同计发月数计算时，100%档个人账户积累更多；

3. 总养老金 ：两者差额约为1/3。

三、医疗待遇差异

1. 个人医疗账户 ：100%档每月可积累更多资金；

2. 医保报销比例 ：在相同报销范围内，100%档可报销更多金额；

3. 门诊待遇 ：部分城市100%档可能享受更高门诊报销比例或封顶线。

四、其他待遇差异

不同地区对灵活就业人员社保待遇的差异较大，但普遍存在以下情况：

1. 生育津贴 ：100%档可能享受更高额度；

2. 工伤保险 ：100%档参保可获工伤保障，60%档无法参保；

3. 其他补贴 ：部分地区可能对100%档给予额外补贴或优惠。

五、选择建议

• 选择100%档 ：适合经济条件较好、希望获得更高退休待遇和医疗保障的人群；

• 选择60%档 ：适合经济压力较大、可承担较低缴费成本的人群。

建议根据自身经济状况和未来养老、医疗需求综合决策，并咨询当地社保机构了解具体待遇细则。