关于新农合个人医保重复缴费的退费问题，根据搜索结果，可参考以下处理方式：

一、重复参保的退费情形

1. 城乡重复参保

若同时参加了新农合和城镇职工医保/城镇居民医保，可保留其中一项，申请终止另一项并退还重复缴费金额。

2. 缴费错误导致的重复缴费

因网络故障、系统错误等原因多次扣费，且能提供银行流水等证明材料，可向当地社保机构申请退费。

3. 特殊人群政策补贴退费

如五保户、低保户因政策优惠多缴了费用，可申请退还多缴部分。

4. 缴费人员去世后的退费

缴费人去世后，其重复缴费部分可申请退还。

二、退费办理流程

1. 线上申请

通过当地社保机构官网或官方APP（如12366纳税服务应用）提交退费申请，需提供身份证、缴费凭证、重复缴费证明等材料。

2. 线下办理

携带身份证、社保卡、新农合证等材料到当地社保中心或新农合中心窗口办理退费手续。

三、注意事项

1. 退费时效

部分地区规定退费需在缴费后15个工作日内办理，逾期可能无法处理。

2. 保留参保选择

新农合与社保不可同时参保，需根据自身需求选择保留其中一份，另一份自动终止。

3. 特殊情况处理

• 多地重复参保需根据参保地政策选择保留地；

• 系统错误导致的重复缴费需提供银行流水等证据。

建议办理前咨询当地社保机构，确认具体退费政策和所需材料，避免因政策差异影响退费进度。