根据搜索结果，南京和杭州在社保缴纳基数方面存在差异，具体分析如下：

一、公积金缴纳基数对比

1. 南京案例

某明星互联网公司员工月薪1.2万元，但公积金基数仅为2800元，远低于市场平均水平。

2. 杭州案例

同样月薪1.2万元的互联网公司，公积金基数高达4200元，接近或达到两地公积金上限。

结论 ：杭州的公积金缴纳基数显著高于南京，反映了杭州在互联网企业员工福利方面的优势。

二、社保整体水平差异

1. 公积金

杭州普遍实行“顶格缴纳”政策，即公积金缴存比例和基数均达到上限，而南京存在明显不足，部分企业甚至低于法定最低标准。

2. 社保其他项目

搜索结果未详细提及社保其他项目（如社保缴费比例、待遇水平等），但公积金作为社保的重要组成部分，其差异对整体社保水平有重要影响。

综合结论 ：杭州的社保（尤其是公积金）整体水平高于南京。

三、可能原因分析

1. 经济水平差异

杭州作为新一线城市，经济发达程度较高，企业有更强的财政实力提供更高福利。

2. 政策导向差异

两地社保政策存在差异，杭州可能更注重吸引高端人才，通过提高公积金等福利增强竞争力。

建议

• 员工角度 ：若在南京工作，可关注企业是否依法履行社保义务；若在杭州，可优先选择公积金缴纳基数较高的企业。

• 政策建议 ：建议两地政府加强社保政策协调，缩小地区间企业福利差距。