55%
根据最新的信息，六安新农合在合肥住院的报销比例如下：
- 乡（镇）卫生院 ：
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300元以下的，报销30%；
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300元（不含）以上2000元以下的，报销70%；
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2000元（不含）以上的，报销50%。
- 县级定点医疗机构 ：
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500元以下的，报销25%；
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500元（不含）以上10000元以下的，报销65%；
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10000元（不含）以上的，报销50%。
- 二级医院 ：
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500元以下的，报销25%；
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500元（不含）以上10000元以下的，报销55%；
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10000元（不含）以上的，报销50%。
- 三级医院 ：
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1000元以下的，报销20%；
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1000元（不含）以上10000元以下的，报销45%；
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10000元以上（不含）的，报销40%。
六安新农合在合肥住院的报销比例根据医疗机构的级别有所不同，具体报销比例可以参考上述详细数据。建议在就医前咨询当地医保部门或医疗机构，以获取最准确的报销信息。