合作医疗（新农合）缴费后，资金的使用主要有以下几个方面：

1. 门诊补偿 ：一部分资金用于农民的门诊补偿，当农民在定点医疗机构看门诊时可以获得一定比例的费用报销。即使个人在某一年没有使用到报销权益，其缴纳的费用也会和其他参保人的费用一起共同构成门诊补偿资金池，为有需要的门诊患者提供保障。

2. 住院补偿 ：这是新农合资金的一个重要用途，对于农民来说一旦患上重大疾病需要住院治疗，新农合基金将为其报销大部分的住院费用，避免农民因高额的医疗费用而陷入贫困。没使用报销的农民所交的费用也会和其他参保人的费用一起共同构成住院补偿资金池，为有需要的住院患者提供保障。

3. 支付医疗机构的服务费用 ：定点医疗机构为农民提供医疗服务，新农合基金按照一定的标准向医疗机构支付费用，这既保证了医疗机构的正常运转，又为农民提供了优质的医疗服务，例如乡镇卫生院、村卫生室等基层医疗机构的运行在一定程度上依赖于新农合基金的支付。

4. 滚存到下一个财政年度 ：新农合基金并不是静态的存款，它们不会因未使用而消失。相反，在新农合计划中，有一种前瞻性的资金流动机制。当一个财政年度结束，而基金依然充裕时，这些资金不会简单地以现金形式退还给个人，而是滚存到下一个财政年度的基金池中。这种安排不仅保障了新农合计划的长期稳定，还增强了整体资金的流动性，意味着未来的健康需求也能得到更坚实的保障。

综上所述，合作医疗缴费后，资金并没有“消失”，而是被合理地运用到了农民的医疗保障及相关的管理服务中。即使个人在某一年没有使用到报销权益，其缴纳的费用也为整个新农合体系的稳定运行和其他患者的医疗保障做出了贡献。