医保卡和农合卡的主要区别体现在以下几个方面：
- 使用人群不同 ：
- 医保卡主要针对的是城镇职工和城镇居民，而农合卡则主要针对农村居民，且常以家庭为单位整户参保。
- 功能和报销范围不同 ：
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医保卡具有更广泛的功能和报销范围，可以在定点药店购买药品，也可以在定点医院报销医疗费用。
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农合卡主要在乡镇卫生院和村卫生室使用，用于报销农村居民的医疗费用，其可报销的医药目录比城镇医保少，且报销比例和最高封顶线也相对较低。
- 管理部门不同 ：
- 医保卡由人社部门管理，而农合卡多数地方由卫生部门管理。
- 缴费方式和费用不同 ：
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医保的缴费方式是由职工和公司一起承担费用，缴费较高，一年几千甚至上万。
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农合的缴费主体是农民个人、集体和政府，缴费相对较低，一年数百元。
- 保障待遇侧重点不同 ：
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医保主要保障住院和门诊大病，兼顾普通门诊，住院及门诊大病待遇较高。
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农合主要保障农民看病就医，门诊待遇水平总体要高于城镇居民医保，但住院及门诊大病待遇相对较低。
- 包含项目不同 ：
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医保除了包括医疗保险外，还包括养老、失业、工伤和生育保险。
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农合只包含医疗保险。
- 购买方式不同 ：
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医保需要用人单位和职工共同缴纳，具有强制性。
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农合是农民自愿参加，没有强制性，需要以家庭为单位整户参加，且每年都要办理参保缴费手续。
- 退休年龄和待遇不同 ：
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城镇职工医保在达到退休年龄，满足当地医保退休年限要求后，可以医保退休，终身享受免费医保待遇。
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农合没有退休政策，终身需要缴费。
综上所述，医保卡和农合卡在覆盖对象、功能、报销范围、管理部门、缴费方式和费用、保障待遇、包含项目以及购买方式等方面存在明显的差异。建议根据个人户籍和就业情况选择合适的医疗保障方式。