社会医保和合作医疗的报销区别主要体现在以下几个方面：
- 投保对象 ：
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社会医保 ：主要针对城市居民及企业职工，分为居民医保和职工医保两种。
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合作医疗 ：主要针对农村户口居民，即新型农村合作医疗（新农合）。
- 缴费标准 ：
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社会医保 ：
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职工医保 ：与个人工资及当地平均工资挂钩，个人和公司共同缴纳。
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居民医保 ：每年固定金额，由个人和政府共同承担。
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合作医疗 ：由农民每人每年交一小部分钱，国家出大头组成。
- 报销比例 ：
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社会医保 ：
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职工医保 ：报销比例较高，政策范围内住院费用报销比例达80%以上。
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居民医保 ：报销比例相对较低，政策范围内住院费用报销比例约为70%。
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合作医疗 ：报销比例较低，但正在逐渐向医保报销比例靠近。
- 报销范围 ：
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社会医保 ：覆盖范围广，包括住院、门诊、药店买药等多种医疗费用。
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合作医疗 ：目前主要在住院时才能报销，少部分城市支持门诊报销。
- 保障期限 ：
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社会医保 ：要求持续缴纳最少15年才可以享受终身医保待遇。
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合作医疗 ：一般是一年交一年，不保证终身保障。
- 管理方式 ：
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社会医保 ：由社保系统管理。
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合作医疗 ：由卫生局业务管理。
- 账户管理 ：
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社会医保 ：设有个人账户和统筹账户，个人缴纳部分进入个人账户，公司缴纳部分进入统筹账户，可用于门诊和住院报销。
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合作医疗 ：个人缴纳的资金主要用于住院报销，具体使用范围有限。
综上所述，社会医保和合作医疗在投保对象、缴费标准、报销比例、报销范围、保障期限、管理方式及账户管理等方面存在明显差异。建议根据自身情况选择合适的医疗保障方式，以确保获得充分和及时的医疗保障。