职工参保合作医疗和医保的区别主要体现在以下几个方面：
- 适用人群不同 ：
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农村合作医疗保险 ：只有农村户口的人才能够办理，其他非农户口不能办理。
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职工医保 ：城镇所有用人单位及其职工都要参加，包括企业、机关、事业单位、社会团体、民办非企业单位等。
- 缴费方式不同 ：
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农村合作医疗保险 ：农民自愿参加，没有强制性，需要以家庭为单位整户参加，每年都要办理参保缴费手续。
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职工医保 ：具有强制性，用人单位必须为员工办理，单位和个人共同承担费用，且达到一定的缴费年限后，后续费用通过工资扣除。
- 享受待遇不同 ：
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职工医保 ：参保人员可享受住院费用报销、统筹病种门诊费用报销以及用于支付门诊医疗费的个人账户待遇，报销比例较城镇居民医疗保险高一些。
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农村合作医疗保险 ：报销范围相对较窄，通常只能报销基本的医疗费用，如药品费、手术费、住院费等，且报销比例相对较低。
- 就医管理要求不同 ：
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职工医保 ：参保人员需在医疗保险定点医院就医，方可享受报销待遇。
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农村合作医疗保险 ：虽然报销比例较低，但就医管理相对灵活，具体报销比例和范围根据当地政策调整。
- 资金来源及缴费标准不同 ：
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农村合作医疗保险 ：主要由农民个人每年缴费，国家财政也会给予一定的补贴，缴费标准较低，且随着政策调整而变化。
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职工医保 ：由单位和个人共同缴费，单位按照规定的比例缴纳医疗保险费，个人也按照一定的比例缴纳，缴费标准较高，且相对稳定。
- 连续性和应用范围不同 ：
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职工医保 ：属于终身保险，只要参保人未到达法定退休年龄且累计缴费达到当地规定年限，就可以享受终身医保待遇，不论何时发生医疗费用都可以进行报销。
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农村合作医疗保险 ：属于一年期的保险，如果在保险期间内参保人发生了医疗费用，只能获得当年的报销，未发生报销情况则第二年会自动清零。
综上所述，职工参保合作医疗和医保在适用人群、缴费方式、享受待遇、就医管理要求、资金来源及缴费标准、连续性和应用范围等方面存在明显差异。建议根据自身情况选择合适的医疗保险类型，以获得更好的医疗保障。