特殊门诊和住院报销在医保报销政策中有一些相似之处，但也有明显的区别，具体如下：
报销比例
相同点：部分地区特殊门诊的报销比例会参照住院报销比例执行。例如在江苏盐城，职工医保的特殊门诊报销比例为70%，与住院报销比例相同。
不同点：在一些地方，特殊门诊的报销比例可能低于住院报销比例。如城乡居民医保的特殊病种门诊治疗报销比例可能为80%左右，而住院报销比例在一级医疗机构及以下可达90%，二级医疗机构80%，三级医疗机构65%。
起付线
相同点：部分地区特殊门诊和住院的起付线是合并计算的。例如在福州市，恶性肿瘤化学治疗和放射治疗特殊病种的起付线为600元，与普通门诊和特殊门诊的起付线合并计算。
不同点：不同地区的起付线标准可能不同，且特殊门诊的起付线可能低于住院起付线。如城乡居民医保的住院起付线为一级医疗机构及以下200元，二级医疗机构460元，三级医疗机构700元，而特殊门诊可能没有单独的起付线或者起付线较低。
报销范围
相同点：两者都涵盖医保目录内的医疗费用。包括药品费、检查费、治疗费等。
不同点：特殊门诊主要针对一些特定的慢性病、重大疾病等在门诊进行的长期治疗，如恶性肿瘤的放化疗、慢性肾功能衰竭的透析等，而住院报销则涵盖所有在住院期间产生的医疗费用。
报销限额
相同点：部分地区特殊门诊和住院的报销限额是共用的。例如在福州市，特殊门诊的年度最高支付限额与住院共用封顶线。
不同点：特殊门诊的报销限额可能根据病种有所不同，且通常低于住院报销限额。如城乡居民医保的特殊门诊年度最高支付限额可能为几万元，而住院报销的年度封顶线可能更高。
就医管理
相同点：两者都需要在定点医疗机构就医。参保人员需要选择医保定点的医院或诊所进行治疗，才能享受医保报销待遇。
不同点：特殊门诊可能需要事先申请认定。参保人员需要提供相关病历资料，经过医保部门或指定医疗机构的审核认定，才能享受特殊门诊报销待遇。而住院治疗一般不需要事先申请认定，只需在住院期间按照规定办理医保住院登记即可。
综上所述，特殊门诊和住院报销在报销比例、起付线、报销范围、报销限额和就医管理等方面存在一定的差异，但部分地区特殊门诊的报销政策会参照住院报销政策执行，以减轻参保患者的医疗费用负担。
