仁济医院南院和东院的区别主要在于它们的位置和专科特色：
- 位置 ：
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南院 ：位于上海市闵行区江月路2000号。
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东院 ：位于上海市浦东新区浦建路160号。
- 专科特色 ：
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东院 ：作为仁济医院的主院，设有内科、外科、妇产科等多个科室，是一个综合性医院。
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南院 ：专注于心血管疾病的治疗，拥有国内领先的心脏介入治疗技术。
- 其他信息 ：
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西院 ：是肝仿掘病专科医院，拥有国内领先的肝病诊治技术和设备。
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北院 ：是骨科专科医院，拥有国内领先的骨科诊治技术和设备。
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北院 ：也是生殖医学中心，提供所有不孕不育诊疗技术。
根据这些信息，您可以根据自己的病情和就诊科室的需求选择合适的院区。例如，需要进行综合性治疗可以选择东院，需要治疗心血管疾病可以选择南院，需要治疗肝病可以选择西院，需要治疗骨科疾病可以选择北院。