吴又可对瘟疫病因的认识具有开创性意义，其核心观点可概括如下：

一、病因本质

1. 疠气说

   吴又可提出瘟疫的病因是“疠气”，认为其是一种存在于空气中的特殊致病物质，具有“无形、无象、无声、无臭”的特性，且能通过呼吸传播。这一观点突破了传统六淫（风、寒、暑、湿）的局限，指出瘟疫与普通外感病有本质区别。

2. 物质性基础

   吴又可强调疫病传播是“物者气之化也”，否定了“疫病由非其时而有其气”的传统观念，奠定了瘟疫病因的物质基础。

二、传播途径与特点

1. 传播方式

   疠气通过口鼻侵入人体，病邪潜伏于膜原（相当于现代医学的免疫系统或潜伏感染状态），在表里之间游走，既非表证也非里证。

   “疠气之入，从口鼻而入，所客内不在脏腑，外不在经络，舍于伏膂之内，去表不远，附近于胃，乃表里之分界，是为半表半里。”

2. 流行特征

   疠气具有强传染性，能“无问老少强弱，触之者疾即病”，且常呈区域性流行趋势。

三、治疗原则

1. 驱邪为要

   治疗以驱邪为核心，主张“驱邪三法”：汗法（发汗解表）、下法（通腑泻热）、清法（清热解毒）。

2. 辨证施治

   强调结合患者体质（虚实）、饮食劳倦、情志变化等，制定个性化治疗方案。

四、历史意义

吴又可的“疠气说”比西方早200年提出类似观点，其关于病原体、传播途径的论述与现代病毒学高度契合，为温病学和传染病学的发展奠定基础。