医保与新农合的报销比例差异显著，​​医保整体报销比例更高（住院最高90%），而新农合在基层医疗机构（如乡镇卫生院）的门诊和住院报销优势明显（门诊最高70%，住院最高90%）​​。两者在覆盖人群、保障范围和报销规则上各有侧重，具体选择需结合自身需求。

医保的报销比例通常随医疗机构级别升高而降低，但整体水平较高。例如，职工医保三级医院住院报销可达80%-85%，退休人员更可提升至90%以上；门诊慢性病（如高血压）报销比例与住院一致，且无起付线。相比之下，新农合更注重基层医疗，村卫生室门诊报销60%，乡镇卫生院住院报销可达90%，但对三级医院住院报销比例仅60%左右。新农合对连续参保者有大病报销比例提升政策（最高85%），而医保的大病保险覆盖更广，起付线以上费用分段报销（60%-90%）。

新农合的门诊报销侧重常见病和慢性病，如高血压、糖尿病用药报销70%（乙类药自付10%后计算），年度限额通常较低（如210元）。医保则涵盖更广的门诊类型，普通门诊在一级医院报销70%-80%，但三级医院仅50%-60%。住院方面，新农合一级医院报销比例与医保接近（均超85%），但二级以上医院差距拉大，医保普遍比新农合高10%-20%。

​​提示​​：参保人应根据常就诊的医院级别、疾病类型（如慢性病需长期门诊）及异地就医需求综合选择。经济发达地区医保待遇更优，而新农合对农村低收入群体更友好，部分地区还提供低保户额外报销（最高95%）。建议优先使用基层医疗机构以最大化报销收益，并关注年度限额与起付线规则。