关于农村合作医疗（新农合）与职工医疗保险的冲突问题，综合权威信息整理如下：

一、核心冲突点

1. 参保资格互斥

   根据国家规定，同一人不能同时参加职工医保和新型农村合作医疗（新农合）。若重复参保，需办理退保手续。

2. 报销规则限制

   两者均属于社会医疗保险体系，医疗费用报销时只能选择其中一种。若同时参保，需主动放弃其中一种以享受全额报销。

二、具体处理建议

1. 优先选择职工医保

   职工医保的报销比例（通常70%以上）和待遇水平显著高于新农合（仅50%左右），且包含门诊、住院等更全面的保障，建议优先保留。

2. 特殊情况处理

   • 地域差异 ：若在农村居住但城市有稳定工作，可咨询当地医保部门，部分地区允许灵活选择参保类型。

   • 重复参保处理 ：若已参保职工医保后新增新农合，需办理职工医保退保，但无法恢复参保资格。

3. 缴费与账户管理

   • 职工医保由单位和个人共同缴费，个人账户可累计使用；新农合无个人账户，每年缴费一次。

   • 若已参加职工医保，无需再缴纳新农合费用。

三、注意事项

• 政策差异 ：具体报销比例和待遇可能因地区政策不同存在差异，建议咨询当地医保部门获取准确信息。

• 转移接续 ：职工医保个人账户余额可转移至其他城市职工医保，但新农合无法直接转移。

建议根据自身身份（城镇职工/农村居民）及就医需求，选择职工医保作为主要医疗保障，避免重复参保以降低医疗负担。