关于生育津贴是否扣除五险单位部分的问题，综合相关法律规定和实际操作情况，具体说明如下：

一、生育津贴的发放原则

1. 替代工资性质

   生育津贴是用人单位在职工产假期间按其原工资标准发放的福利，用于弥补因生育无法工作期间的经济损失。

2. 计算标准

   通常以职工所在单位上年度职工月平均工资为基数计算，与职工个人缴费基数无关。

二、五险一金扣除规则

1. 单位应缴部分不扣除

   生育津贴属于生育保险待遇，由生育保险基金支付，单位无需从津贴中扣除已缴纳的五险一金单位部分。

2. 个人承担部分需扣除

   若单位在产假期间仍为职工缴纳五险一金，则生育津贴需扣除职工个人承担的缴费部分（如社保个人账户金额）后再发放。

三、特殊情况说明

• 单位违规未缴 ：若单位未依法缴纳生育保险费，可能影响津贴的发放金额或时间，但不会直接从津贴中扣除五险一金。

• 地区政策差异 ：具体操作可能因地方政策不同存在差异，建议咨询当地社保部门确认。

四、其他注意事项

• 个人所得税计算 ：生育津贴通常不计入工资薪金所得，无需缴纳个人所得税；若津贴超过生育医疗费用报销标准，超出部分需并入工资薪金征税。

生育津贴在正常情况下只需扣除职工个人承担的五险一金部分，单位已缴部分由基金支付。若存在疑问，建议通过劳动仲裁或社保部门咨询确认。