在内蒙古包头，社保基数为5000元时，个人所得税的扣税情况如下：每月需缴纳的个税约为15元。 以下是详细的计算和解释：

1. 1.社保缴费比例及金额：养老保险：个人缴纳8%，即5000元×8%=400元。医疗保险：个人缴纳2%，即5000元×2%=100元。失业保险：个人缴纳0.5%，即5000元×0.5%=25元。住房公积金：假设个人缴纳比例为12%，即5000元×12%=600元。以上社保及公积金总缴费金额为400元+100元+25元+600元=1125元。
2. 2.应纳税所得额计算：应纳税所得额=社保基数-五险一金-免征额。免征额为5000元，因此应纳税所得额=5000元-1125元-5000元=-1125元。由于应纳税所得额为负数，因此无需缴纳个人所得税。
3. 3.特殊情况下的个税计算：如果社保基数调整或其他扣除项变化，导致应纳税所得额为正数，则需按个人所得税税率表计算。例如，若应纳税所得额为1000元，则适用3%的税率，个税为1000元×3%=30元。
4. 4.其他扣除项的影响：如果有额外的专项附加扣除（如子女教育、继续教育、大病医疗等），应纳税所得额会进一步减少，可能无需缴纳个税或减少个税金额。例如，若有1000元的专项附加扣除，应纳税所得额将变为-2125元（-1125元-1000元），同样无需缴纳个税。

在内蒙古包头，社保基数为5000元时，通常情况下无需缴纳个人所得税，因为扣除社保和免征额后，应纳税所得额为负数。只有在特定情况下，如社保基数调整或扣除项变化，导致应纳税所得额为正数时，才需按税率缴纳个税。了解这些信息有助于更好地规划个人财务，确保合理缴纳各项费用。